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Automações77 mil · #1524

seqera-automation

Ajuda seu agente a automatizar fluxos de trabalho no Seqera. Ele executa tarefas complexas de forma independente.

O que ela faz

Esta ferramenta ajuda a automatizar tarefas no Seqera, uma plataforma para gerenciar fluxos de trabalho científicos. Ela usa um sistema chamado Rube MCP para se conectar e executar essas tarefas.

Quando usar

  • ✓Quando você precisa executar um fluxo de trabalho no Seqera.
  • ✓Ao gerenciar conexões com o Seqera.
  • ✓Para descobrir quais ferramentas estão disponíveis no Seqera.

Exemplo do que pedir para a IA

“Automatize a execução de um fluxo de trabalho no Seqera para análise genômica.”

Quer saber mais? Abra as seções abaixo.

Como usar

O jeito mais fácil: copie a mensagem abaixo e cole no Claude, ChatGPT, Cursor ou outra IA. Ela lê a skill e segue as instruções.

Link da skill

https://github.com/ComposioHQ/awesome-claude-skills/blob/master/composio-skills/seqera-automation/SKILL.md

Mensagem pronta para colar

Use esta skill para me ajudar: https://github.com/ComposioHQ/awesome-claude-skills/blob/master/composio-skills/seqera-automation/SKILL.md Leia o arquivo SKILL.md desse link e siga as instruções dele na minha tarefa.
Como funciona

Primeiro, você precisa configurar o Rube MCP e conectar sua conta Seqera. Depois, a IA busca as ferramentas disponíveis e executa a tarefa que você pediu.

Instalação

Jeito mais fácil: copie o link da skill e cole no Claude, ChatGPT ou Cursor pedindo para seguir as instruções.

No terminal (Claude Code, Codex, Cursor), na pasta do projeto:

npx skills add ComposioHQ/awesome-claude-skills --skill seqera-automation

Ou baixe só o arquivo:

curl -L https://raw.githubusercontent.com/ComposioHQ/awesome-claude-skills/master/composio-skills/seqera-automation/SKILL.md -o SKILL.md
Conteúdo técnico (SKILL.md)

Tradução do texto original do autor no GitHub. Os comandos e códigos estão como no original.

Automação Seqera via Rube MCP

Automatize operações Seqera através do toolkit Seqera da Composio via Rube MCP.

Documentação do Toolkit: composio.dev/toolkits/seqera

Pré-requisitos

  • O Rube MCP deve estar conectado (RUBE_SEARCH_TOOLS disponível)
  • Conexão Seqera ativa via RUBE_MANAGE_CONNECTIONS com o toolkit seqera
  • Sempre chame RUBE_SEARCH_TOOLS primeiro para obter os esquemas de ferramentas atuais

Configuração

Obter Rube MCP: Adicione https://rube.app/mcp como um servidor MCP na configuração do seu cliente. Nenhuma chave de API é necessária — basta adicionar o endpoint e funciona.

  1. Verifique se o Rube MCP está disponível confirmando que RUBE_SEARCH_TOOLS responde
  2. Chame RUBE_MANAGE_CONNECTIONS com o toolkit seqera
  3. Se a conexão não estiver ATIVA, siga o link de autenticação retornado para completar a configuração
  4. Confirme se o status da conexão mostra ATIVA antes de executar quaisquer fluxos de trabalho

Descoberta de Ferramentas

Sempre descubra as ferramentas disponíveis antes de executar fluxos de trabalho:

RUBE_SEARCH_TOOLS
queries: [{use_case: "Seqera operations", known_fields: ""}]
session: {generate_id: true}

Isso retorna os slugs das ferramentas disponíveis, esquemas de entrada, planos de execução recomendados e armadilhas conhecidas.

Padrão de Fluxo de Trabalho Principal

Etapa 1: Descobrir Ferramentas Disponíveis

RUBE_SEARCH_TOOLS
queries: [{use_case: "your specific Seqera task"}]
session: {id: "existing_session_id"}

Etapa 2: Verificar Conexão

RUBE_MANAGE_CONNECTIONS
toolkits: ["seqera"]
session_id: "your_session_id"

Etapa 3: Executar Ferramentas

RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL
tools: [{
  tool_slug: "TOOL_SLUG_FROM_SEARCH",
  arguments: {/* schema-compliant args from search results */}
}]
memory: {}
session_id: "your_session_id"

Armadilhas Conhecidas

  • Sempre pesquise primeiro: Os esquemas de ferramentas mudam. Nunca codifique slugs ou argumentos de ferramentas sem chamar RUBE_SEARCH_TOOLS
  • Verificar conexão: Verifique se RUBE_MANAGE_CONNECTIONS mostra o status ATIVA antes de executar ferramentas
  • Conformidade de esquema: Use nomes de campos e tipos exatos dos resultados da pesquisa
  • Parâmetro de memória: Sempre inclua memory nas chamadas RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL, mesmo que vazio ({})
  • Reutilização de sessão: Reutilize IDs de sessão dentro de um fluxo de trabalho. Gere novos para novos fluxos de trabalho
  • Paginação: Verifique as respostas em busca de tokens de paginação e continue buscando até que esteja completo

Referência Rápida

Operação Abordagem
Encontrar ferramentas RUBE_SEARCH_TOOLS com caso de uso específico do Seqera
Conectar RUBE_MANAGE_CONNECTIONS com o toolkit seqera
Executar RUBE_MULTI_EXECUTE_TOOL com slugs de ferramentas descobertas
Operações em massa RUBE_REMOTE_WORKBENCH com run_composio_tool()
Esquema completo RUBE_GET_TOOL_SCHEMAS para ferramentas com schemaRef

Alimentado por Composio

Perguntas frequentes

O que é Rube MCP?

É um sistema que permite à IA interagir com outras ferramentas e plataformas, como o Seqera, sem precisar de chaves de API extras.

Preciso de alguma chave secreta?

Não, o Rube MCP não precisa de chaves de API. Basta adicionar o endereço do servidor Rube no seu cliente.

Por que devo sempre buscar as ferramentas primeiro?

Porque as ferramentas e suas configurações (esquemas) podem mudar. Buscar primeiro garante que a IA use as informações mais recentes e evite erros.

Detalhes

Descrição original do autor

Automate Seqera tasks via Rube MCP (Composio). Always search tools first for current schemas.

repo: ComposioHQ/awesome-claude-skills

Popularidade

Estrelas no GitHub
77 mil
Posição no ranking
#1524
Licença
—
Atualizada em
18/09/2026

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